حدس دقيق سير بيماري از ابتداي بيماري امكان‌پذير نيست اما برخي موارد به نفع خوش خيم بودن سير بيماري مي‌باشد. از جمله مواردي كه به نفع خوش خيم بودن سير بيماري است تعداد عود كمتر بويژه در طي سال‌هاي اول شروع بيماري است. هر چقدر فاصله بين حملات بيشتر باشد و بعد از هر حمله بهبودي كامل ايجاد شود احتمال بروز ناتواني در سالهاي بعدي نيز كمتر است. در نژاد سفيدپوست اروپائي و آمريكائي احتمال بروز ام اس بيشتر بوده و احتمال ناتواني نيز بيشتر است. قبلاً گمان مي‌شد كه بروز علائم حسي مثل گزگز و سوزن‌سوزن شدن يا بي‌حسي قسمتي از بدن، كاهش بينايي از جمله علائم نشانگر خوش خيم بودن بيماري هستند. بعلاوه گفته می شود که شروع بيماري در سنين جواني و جنسيت مونث نيز از پيش‌اگهي بهتري برخوردار است. اما این مطلب به اثبات نرسیده است. آنچه در حال حاضر بیشتر مطرح است شامل موارد زیر است: 

سير عود و بهبود نسبت به ساير سيرها بهتر است.

علائم ادراري در ابتداي بيماري از نشانگر شدت بيماري است.

بهبودي ناقص از حمله اول و حملات مكرر طي سال اول نيز پيش‌آگهي را بد مي‌كند.

حجم زياد پلاك در MRI در 5 سال اول بيماري شدت بيماري را پیش بینی می کند.